Щоб покращити розуміння наших генетичних планів, дослідники створили базу даних генів, про які ми майже нічого не знаємо.
Хоча ми знаємо, що ці гени існують і кодують білки, ми поняття не маємо, для чого вони потрібні.
“Стало зрозуміло, що наукові дослідження, як правило, зосереджуються на добре вивчених білках, що призводить до занепокоєння, що маловивченими генами невиправдано нехтують”, – пояснюють дослідники з Лабораторії молекулярної біології MRC (LMB) у Великобританії.
“Щоб вирішити цю проблему, ми розробили загальнодоступну базу даних Unknome, яку можна налаштувати”.
Минуло 20 років відтоді, як вперше було опубліковано чорновий варіант послідовності геному людини, що містить десятки тисяч генів.
З тих пір ми багато чому навчилися завдяки передовим технологіям, таким як CRISPR, але десятки тисяч цих генів все ще залишаються загадковими.
Існує багато причин, чому ці гени досі залишаються поза увагою науки, пояснюють молекулярний біолог Жоао Роша та його колеги.
Серед них – фінансування та системи експертної оцінки, які більше орієнтовані на підтримку досліджень генів з уже доведеним клінічним значенням, або генів, які є більш поширеними або більш поширеними серед лабораторних видів.
База даних Unknome ранжує білкові гени відповідно до того, наскільки мало відомо про них для людини та інших видів, які зазвичай вивчаються в лабораторних умовах.
Щоб продемонструвати, як можна використовувати цю базу даних, дослідники взяли вибірку з 260 наших генів, віднесених до категорії маловідомих у базі даних, які також можна знайти в геномі лабораторної мушки дрозофіли.
Вони систематично видаляли спільні гени у мух, що розвивалися. Багато мух не вижило, продемонструвавши, що білки, які кодує кожен з цих генів, відіграють вирішальну роль у біології тварин.
“Ці нехарактеризовані гени не заслуговували на те, щоб ними нехтували”, – каже молекулярний біолог Шон Манро.
Видаляючи експресію генів лише в деяких тканинах мух, але не в інших, дослідники змогли визначити деякі з їхніх функцій. Деякі з генів пов’язані з чоловічою фертильністю, розвитком і реакцією на стрес.
“Існує потенціал для прискорення наукового прогресу шляхом виявлення ситуацій, коли питаннями ненавмисно і невиправдано нехтують”, – пише команда.
Роша та його колеги визначили ці питання в геномі людини, і тепер дослідники з усього світу повинні допомогти прискорити цей прогрес.
“Наша база даних забезпечує потужну, універсальну та ефективну платформу для ідентифікації та відбору важливих генів з невідомою функцією для аналізу, тим самим прискорюючи заповнення прогалини в біологічних знаннях, яку представляє собою непізнаний геном”, – підсумовує Манро.